Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异基因调控高效率全景图

东京帝国大学的研究者执法人员和RIKEN Research研究者所的同事们早已建立直接联系了首个针对自身病原体性传染病和自身上皮细胞性传染病的基因物质统计数据库。希望这一天然资源能为病原体传染病的发展提供新的见解，并可能格外进一步药物的注意到。科学家们还希望，与病原体关的的基因物质碱基统计数据图谱再次可能应用于诸如COVID-19等传染病的研究者。

东京帝国大学概念设计研究者经理，临床风湿病学家，功用基因物质碱基学专家Mineto Ota助手感叹：“要了解到传染病，就需要深刻理解基因物质反转的功用。有了这个统计数据集，我们就可以将与传染病关的的DNA碱基变化的统计数据与对传染病发病机制十分举足轻重的基因物质和巨噬细胞型式直接联系上去。”Ota是该团队撰写在《Cell》杂志上的文章的主要笔记，文章标题为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该概念设计是与Chugai Pharmaceutical的科学家们合作顺利进行的。

笔记确信，病原体特异性的传染病（IMD）之外从自身病原体性到自身上皮细胞的多种生理。他们宣称有，尽管IMD当中炎性巨噬细胞因子的异常户外活动证明病原体巨噬细胞功用再次发生了变化，但是，“对于IMD的关的基因物质甚至关的巨噬细胞型式相吻合。”

正因如此基因物质碱基关联研究者（GWAS）注意到了许多与IMD关的的基因物质碱基位点。但是，在此类关联研究者当中比对出有的许多基因物质反转都位处抑制基因物质“on”或“off”隐含的DNA非编码区域，而不是位处基因物质编码碱基当中。研究者小组宣称有：“GWAS早已了解到了许多与复杂表现型和传染病关的的基因物质碱基位点，之外IMD。这些反转当中的大多数都位处非编码基因物质碱基区域，尤其是催化反应元件，如增强子和残基。”

为了了解到催化反应DNA的功用，一种相异型式的基因物质碱基研究，被称作隐含定量表现型基因物质位点（eQTL），旨在将DNA碱基的差别与基因物质隐含的差别直接联系上去。利用eQTL统计数据，研究者执法人员可以对催化反应DNA碱基的用意、催化反应碱基当中的反转如何因素其催化反应基因物质的隐含以及这些基因物质隐含差别如何致使传染病做出有格外明智的揣测。

其它针对病原体的eQTL研究者早已在顺利进行当中，但先前的研究者工作只之外身心健康志愿，并检查了有限数量的巨噬细胞型式。研究者执法人员确信：“对身心健康供体病原体巨噬细胞的研究者可能未曾能捕获传染病静止状态下注意到的一系列eQTL振荡。此外，虽然对病原体巨噬细胞的各种类型激发可以在某种程度上模拟传染病静止状态，但并不显然了解到出有人体内的认知环境。”

Ota补充道：“上皮细胞静止状态下，病原体巨噬细胞的物理功能性与身心健康静止状态下的相同巨噬细胞截然相异。与病原体持续性关的的基因物质反转可能只在患病静止状态下起作用，因此对于这种型式的基因物质研究者，从单纯病人身上获取采样十分举足轻重。”

在他们当前报道的研究者当中，研究者小组对79名身心健康志愿和337名被诊断患有10种相异型式病原体特异性传染病（之外类风湿性关节炎、不足之处红斑狼疮和不足之处硬化症）的病人顺利进行了正因如此基因物质碱基DNA。所有志愿都是日本混血。

了解到病原体特异性的传染病较强潜力，因为尽管每种传染病在临床上都是相异的，但仍有许多重叠之一处，并且较强相同诊断的病人可能会表现出有十分相异的症状。研究者执法人员补充感叹：“由于所有这些生态，一次学习一种病原体特异性传染病的意志力是有限的。但是，如果我们独自一人研究者10种传染病，就可以格外正因如此面地了解到这些型式的传染病。”

在完成正因如此基因物质碱基DNA后，研究者执法人员从志愿的血液采样当中分离出有28种相异型式的病原体关的巨噬细胞，并测量了这些巨噬细胞当中的基因物质隐含。“我们在图谱当中看到，每种病原体巨噬细胞型式都有相异的eQTL结果，这可以告诉我们巨噬细胞型式错综复杂基因物质催化反应的差别，以及哪种巨噬细胞型式对于发展哪种传染病至关举足轻重。”研究者执法人员感叹。

笔记报告感叹，“在基因物质隐含研究当中，我们在一个平台上对多个IMD顺利进行比较，使我们能够描述每个传染病（病人）的特征，并识别与单个传染病特异性关的的基因物质，以及在一组IMD当中失调的通路……我们的统计数据集使我们能够检测每个特定巨噬细胞型式当中eQTL振荡的认知（传染病）氛围液压的冲击。”

研究者执法人员将得到的天然资源定名为为东京帝国大学病原体巨噬细胞基因物质隐含图谱（ImmuNexUT），并感叹它代表了应用于亚洲地区混血志愿建立直接联系的小得多的eQTL统计数据集。他们论述道：“我们确定了病原体巨噬细胞型式特异性的eQTL振荡，之外以前未曾报道的罕见巨噬细胞型式，它们在认知上皮细胞需要下的生态，以及这些eQTL与IMD基因错综复杂的显著关联。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的基因物质碱基和功用基因物质碱基研究者主要是利用欧陆人口为120人顺利进行的，尽管群体生态对于精确理解基因物质碱基功用至关举足轻重。”研究者执法人员感叹，“这个日本受试者的eQTL图谱对于克服这种以欧陆为当中心的偏见，结合欧陆的统计数据集进一步研究者DNA反转的功用，也较强举足轻重涵义。”

研究者执法人员希望ImmuNexUT统计数据库将继续增长，并再次为病人带来能够的结果。他们感叹：“与之前报道的天然资源相比，我们的统计数据集较强独特而有利的特点，之外正因如此面的病原体巨噬细胞可分、人口为120人错综复杂病原体持续性的变化以及同质的非欧陆人口为120人。”